Бензиновые моторы — более универсальны. Они подходят для больших дистанций, глиссирования, перевозки грузов. Их легко заправить где угодно, работают дольше без перерыва. Минусы — шум, запах и необходимость обслуживания.
Электрические моторы — тихие, экологичные, не требуют регистрации и прав. Хорошо подходят для троллинга, озёр, заповедников. Минус — ограниченный запас хода, нужно следить за зарядом аккумулятора.
Для серьёзной рыбалки и дальних поездок лучше бензин. Для спокойных прогулок — электромотор.

Расход топлива зависит от мощности, загрузки, скорости и условий воды:
2.5 л.с. — около 1 л/ч
5 л.с. — 1.5–2 л/ч
9.9 л.с. — до 4 л/ч
15–20 л.с. — от 5 до 7 л/ч
Четырёхтактные моторы расходуют на 30–40% меньше, чем двухтактные, при тех же условиях. Расход можно уменьшить, если держать стабильные средние обороты и не перегружать лодку.

В Беларуси права на лодочный мотор нужны, если его мощность превышает 3,7 кВт (5 л.с.); для моторов мощнее требуется пройти обучение и сдать экзамен в Госинспекция по маломерным судам (ГИМС) Министерство по чрезвычайным ситуациям Республики Беларусь (ГИМС) для получения удостоверения, что включает теорию и практику, и это возможно с 18 лет. Если мощность 5 л.с. и меньше, права не нужны, но регистрация лодки и мотора в ГИМС всё равно обязательна.

Главная разница в сути — разный принцип работы двигателя, далее следствия, которые являются плюсами одних моторов или минусами других.
2 тактный двигатель. Плюсы
Легче, чем 4 тактный (2 тактный 9.9 лс двигатель весит примерно 38 кг, 4 тактный 9.9 лс около 50 кг). Двигатель легче из-за отсутствия системы впускных-выпускных клапанов и сложного механизма газораспределения;
Мощнее (при том же самом объеме 2 тактный двигатель мощнее, так как взрыв — полезное действие, происходит при каждом обороте коленчатого вала, в то время как у 4 тактного через оборот);
Проще по конструкции, а следовательно, менее дорогой по обслуживанию.
4 тактный двигатель. Плюсы
Экономичен, расход топлива примерно 250 мл на 1 лс в час; отсутствует расхода масла;
Экологичен, так как выброс неиспользованной топливной смеси исключен;
Низкий уровень шума (по сравнению с 2 тактым двигателем);
Эксплуатация проще, не нужно готовить масло-бензиновую смесь, как у 2 тактного двигателя, просто заливается бензин в бак; нет расхода масла;
Моторесурс больше в разы, чем у 2 тактного двигателя, так как все движущиеся элементы находятся в постоянной смазке (отдельная смазка).

Винт должен обеспечивать работу мотора в среднем или верхнем диапазоне оборотов при максимальной загрузке лодки. Для легких лодок выбирайте винт с большим шагом, для тяжелых — с меньшим шагом. Правильно подобранный винт влияет на ускорение, максимальную скорость, расход топлива и ресурс мотора.

При выборе мощности необходимо учитывать массу лодки с полной загрузкой и максимально допустимую мощность, указанную производителем на транце. Для расчета минимальной мощности используйте формулу: общий вес (лодка + мотор + пассажиры + оборудование) разделить на 30. Полученное значение будет приблизительно соответствовать необходимой мощности для выхода на глиссирование.